走進Vazyme，了解更多關(guān)于諾唯贊的新聞和訊息
上新 | 觸手可及！表觀研究利器ATAC-seq你get了嗎？
發(fā)布時間：
2024-02-26
表觀遺傳是一種在不改變DNA序列的前提下，通過其他機制也能引起基因表達或細胞表型變化的生物學(xué)現(xiàn)象。表觀研究涉及的范圍非常廣泛，包括DNA甲基化，組蛋白修飾，轉(zhuǎn)錄調(diào)控，染色質(zhì)可及性分析等。染色質(zhì)可及性又稱為染色質(zhì)開放程度，反映了染色質(zhì)的轉(zhuǎn)錄活性狀態(tài)，是研究基因表達調(diào)控的重要方向，在表觀遺傳圖譜繪制、細胞分化和發(fā)育及各類疾病的發(fā)生發(fā)展研究中具有重要的作用。
ATAC-Seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是2013年由斯坦福大學(xué)William Greenleaf開發(fā)的檢測開放染色質(zhì)的方法，其原理是利用轉(zhuǎn)座酶Tn5可切割開放染色質(zhì)區(qū)域的特性，對Tn5酶捕獲到的DNA序列進行測序。
相信很多同學(xué)都有嘗試過做ATAC-Seq實驗，不知道大家有沒有遇到過TSS富集不好，信噪比低，IGV視圖背景高的問題呢？經(jīng)小V的不懈努力，為大家?guī)砹?strong>全新ATAC-Seq試劑盒——Hyperactive ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #TD711)，帶你起飛！
新品介紹
Hyperactive ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina是Vazyme新款A(yù)TAC建庫試劑盒，兼容100 - 100,000個細胞投入量，下機數(shù)據(jù)更優(yōu)。更加穩(wěn)定和優(yōu)異的ATAC建庫試劑盒Vazyme #TD711現(xiàn)已升級上市！
產(chǎn)品亮點
兼容100 - 100,000個細胞投入量
TSS富集良好且IGV視圖信噪比高
性能展示
參照Vazyme #TD711實驗流程對100 - 100,000個Hela細胞進行ATAC文庫構(gòu)建，不同細胞投入量下的擴增循環(huán)數(shù)如表1。結(jié)果表明：在不同細胞投入量下，Vazyme #TD711文庫產(chǎn)出穩(wěn)定，文庫峰型呈現(xiàn)典型的Ladder狀分布。
表1. 不同細胞投入量下的擴增循環(huán)數(shù)
圖2. 不同細胞投入量下的文庫產(chǎn)出
圖3. 不同細胞投入量下的文庫峰型
下機數(shù)據(jù)更優(yōu)
將參照Vazyme #TD711實驗流程得到的文庫進行測序，下機后各樣本截取10 G數(shù)據(jù)量進行生信分析，結(jié)果表明：TSS富集圖顯示在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點周圍富集明顯；IGV視圖顯示ATAC在關(guān)鍵位點上的富集情況與CUT&Tag和CUT&RUN一致，且在mRNA-seq中可以找到相應(yīng)基因位點，實驗結(jié)果真實可靠。
圖4. 不同細胞投入量下的TSS富集圖
注：CUT&Tag和CUT&RUN技術(shù)采用的靶點為H3K4me3。
圖5.不同細胞投入量下的IGV視圖
相關(guān)新聞
聯(lián)系方式
技術(shù)支持：support@vazyme.com
市場推廣：marketing@vazyme.com
公司地址：南京經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)科創(chuàng)路紅楓科技園C1-2棟東段1-6層
